Index

A

add_edge() (invcryrep.tobascco_net.Net method) add_edges_between() (invcryrep.tobascco_net.Net method) add_name() (invcryrep.tobascco_net.Net method) add_to_array() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

add_vertex() (invcryrep.tobascco_net.Net method) all_distances() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep static method) all_edges() (invcryrep.tobascco_net.Net method) assign_ip_matrix() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

B

barycentric_embedding() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

C

check_element() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) check_linear_dependency() (invcryrep.tobascco_net.Net method) check_SLICES() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) check_structural_validity() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep static method) cif2structure_graph() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method)

convert_graph() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) convert_params() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep static method) (invcryrep.tobascco_net.Net method) cycle_cocycle (invcryrep.tobascco_net.Net property) cycle_cocycle_check() (invcryrep.tobascco_net.Net method) cycle_cocycle_I (invcryrep.tobascco_net.Net property)

D

debug_print() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

delete_edge() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

E

edges_iter() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

eon_projection (invcryrep.tobascco_net.Net property)

F

file2structure_graph() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) from_cif() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) from_file() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) from_SLICES() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method)

from_structure() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) func() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) func_check() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) function_timeout() (in module invcryrep.invcryrep)

G

gen_networkx_graph_format() (invcryrep.tobascco_net.SystreDB method) gen_sage_graph_format() (invcryrep.tobascco_net.SystreDB method) get_2d_params() (invcryrep.tobascco_net.Net method) get_3d_params() (invcryrep.tobascco_net.Net method) get_canonical_SLICES() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) get_cocycle_basis() (invcryrep.tobascco_net.Net method) get_coordinates() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep static method) get_covered_pair_lj() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) get_cycle_basis() (invcryrep.tobascco_net.Net method) get_dim() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) get_index() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

get_inner_p_target() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) get_inner_p_target_debug() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) get_key() (invcryrep.tobascco_net.SystreDB method) get_lattice_basis() (invcryrep.tobascco_net.Net method) get_metric_tensor() (invcryrep.tobascco_net.Net method) get_name() (invcryrep.tobascco_net.SystreDB method) get_nbf_blist() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) get_rescaled_lattice_vectors() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) get_uncovered_pair() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep static method) get_uncovered_pair_lj() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) get_voltage() (invcryrep.tobascco_net.Net method) graph (invcryrep.tobascco_net.Net property)

I

in_edges() (invcryrep.tobascco_net.Net method) indices_with_voltage() (invcryrep.tobascco_net.Net method) initialize_x_bounds() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep static method) insert_and_join() (invcryrep.tobascco_net.Net method) invcryrep module InvCryRep (class in invcryrep.invcryrep)

invcryrep.config module invcryrep.invcryrep module invcryrep.tobascco_net module is_integral() (invcryrep.tobascco_net.Net method) iter_cycles() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

K

kernel (invcryrep.tobascco_net.Net property)

L

lattice_arcs (invcryrep.tobascco_net.Net property)

linear_independent_vectors() (invcryrep.tobascco_net.Net method) loop_edges() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

M

m3gnet_relax() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) match_check() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) match_check2() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) match_check3() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) match_check4() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method)

minimal (invcryrep.tobascco_net.Net property) module invcryrep invcryrep.config invcryrep.invcryrep invcryrep.tobascco_net

N

Nd_chunks() (invcryrep.tobascco_net.SystreDB method) neighbours() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

Net (class in invcryrep.tobascco_net) nodes_iter() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

O

order (invcryrep.tobascco_net.Net property)

out_edges() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

P

print_edge_count() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

projection (invcryrep.tobascco_net.Net property)

R

read_store_file() (invcryrep.tobascco_net.SystreDB method) report_errors() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

report_errors_nlopt() (invcryrep.tobascco_net.Net method) return_coeff() (invcryrep.tobascco_net.Net method) return_indices() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

S

shape (invcryrep.tobascco_net.Net property) simple_cycle_basis() (invcryrep.tobascco_net.Net method) SLICES2formula() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) SLICES2structure() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method)

structure2crystal_graph_rep() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) structure2SLICES() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) structure2SLICESAug() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) structure2structure_graph() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) SystreDB (class in invcryrep.tobascco_net)

T

to_4structures() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) to_ind() (invcryrep.tobascco_net.Net method) to_relaxed_structure() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method)

to_SLICES() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) to_structure() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method) to_structures() (invcryrep.invcryrep.InvCryRep method)

V

vertex_positions() (invcryrep.tobascco_net.Net method)

vertices() (invcryrep.tobascco_net.Net method)